根据中国船舶工业60年史料集的披露，401艇在建造过程中并不顺利，首次试航之后因艇上出现诸多问题，被迫回到船厂进行全面检修和重建，再次下水的401艇解决了建造工艺问题，不过这也使得401艇和402艇几乎同时服役。1965年底，印尼人道主义危机爆发时，401艇和402艇虽已交付海军，但还在渤海和黄海进行训练试航，艇上的作战系统尚未完成调试。由于前线急需水下作战力量，最后401艇和402艇还是被调去参战，其中只有鱼雷发射管、导弹垂直发射装置不能用的一艘用于在苏比克湾外监视美国海军第七舰队；只有导弹垂直发射装置、鱼雷发射管不能用的一艘进入印尼海域，并在作战中发射巡航导弹攻击了印尼陆上目标。

    总的来说，尽管091型核潜艇有噪声大、水下俯仰操控不够灵活、水下自持力差（主要是给养携带量和艇员生活空间较差）等问题，但该艇齐全的武器系统使得它成为各国首艘核潜艇中最具实战价值的，并由此奠定了中国攻击型核潜艇的基本发展思路。

    二、093型攻击型核潜艇（2艘）

    404艇，1970年10月1日服役，1998年退役，2000年再次服役，2004年第二次退役后拆除

    405艇，1971年4月20日服役，1998年退役，2000年再次服役，2004年第二次退役后拆除

    091型核潜艇开工之后，海军核动力研究中心就开始为第二代核潜艇进行预先研究，主要工作集中在研制新一代核反应堆。根据唐华指出的发展方向，新一代核反应堆除应具有更高的功率密度外，还应具备初等的自然循环能力，以降低潜艇在低速航行时的噪声。

    093型核潜艇从本质上说，就是将反应堆从第一代更换为第二代的091型。第二代艇用核反应堆输出轴功率约16000马力，体积与第一代核反应堆保持一致，在主循环泵不工作的情况下仍可输出小部分功率，让潜艇在水下以10节左右的速度安静航行。武器系统配置与091型完全一致：6具鱼雷发射管和12具导弹垂直发射装置。

    093型服役投入使用后，中国核潜艇开始频繁从高雄附近进入太平洋，在远海追逐和跟踪美国的弹道导弹核潜艇。在093型出现在远海的头几年，中国一直有意隐瞒093型核潜艇反应堆已具备自然循环能力的事实，直至1976年的菲律宾追逐事件中，美国海军才惊悚地发现，一艘093型核潜艇竟然以安静的姿态，用10节的航速悄悄跟在自己后头！

    三、093A型攻击型核潜艇（2艘）

    406艇，1973年3月1日服役，2004年退役

    407艇，1974年3月10日服役，2004年退役

    093A是093的小幅度改进型，反应堆和艇载武器均无变化，但大幅度更新了水声系统和作战指挥中心，在尾舵安装了一部拖曳声呐，大幅度提升了水下探测能力。

    值得一提的是093A型的首艇404艇，它的实战经历极为丰富：1974年的印度核危机中，406艇依联合国安理会授权，使用巡航导弹摧毁了维萨卡帕特南的印度重水处理厂；1981年的缅甸战争中，406艇发射了12枚巡航导弹，摧毁了缅甸中北部的12个陆军目标，炸死军长1名、师长1名；1988年的东印度战争中，406艇先是在安达曼群岛海域击沉印度“维克兰特”号航空母舰，又向西里古里走廊发射巡航导弹摧毁了十余个地面目标；2002年的斯里兰卡危机中，临近退役的406艇老当益壮再次出航，发射鱼雷击毁斯里兰卡反政府组织的1艘18000吨海上游击母船，一次击毙反政府组织人员多达2300人。

    由于406艇历次作战均在印度洋，因而被业余战史爱好者起了“印度洋话事人”的绰号。又因其四次实战有三次是与印度有关，因而又有绰号“印度之友”。退役5年后，406艇确定收入青岛海军博物馆，现在这艘潜艇的反应堆已拆除，艇体也已进入青岛海军博物馆的干坞，预计不久之后就会向游人开放。

    四、093B型攻击型核潜艇（2艘）

    408艇，1976年4月1日服役，2006年退役

    409艇，1977年4月15日服役，2006年退役

    093B是093A的继续改进型，但此次改进的幅度颇大，实际上当时是在为已开始前期规划的新一代095型攻击型做部分艇上系统的试验评测。

    70年代中期，中国核潜艇乃至整个船舶工业的技术水平在迅速提升，大量新技术和新工艺逐渐开始实用化，093B获得了很多可用的新技术，其中包括：

    艇体耐压壳的高强度钢材更新，设计潜深从300米提升到45